清理隔油池时，停止对隔油池的餐厨垃圾投放，然后用清水冲洗即可，一般的隔油池冲洗就可以了，全自动隔油池的用水量就要大一些，可能要半个小时到一个小时左右，过隔油池处理后的污水流到废水坑内，当废水升到浮球控制的水位时，由潜污泵自动排出，当污水降到控制低水位时，潜污泵将自动停止；经分离后的油脂浮在隔油板侧上方，这些浮油脂应及时定期清除，如果不定期处理油脂，可能外泄，若流到地面会造成环境污染，若流到污水坑内会严重影响浮球正常工作。
在寒冷地区，为防止冬季油品凝固，可在集油管底部设蒸汽管加热，隔油池一般都要加盖，并在盖板下设蒸汽管，以便保温，防止隔油池起火和油品挥发，并可防止灰沙进入，在隔油池中沉淀下来的重油及其他杂志，积聚到池底污泥斗中，通过排泥管进入污泥管中，仅仅依靠油滴与水的密度差产生上浮而进行油、水分离，油的去除效率一般为70％～80％左右，隔油池的出水仍含有一定数量的乳化油和附着在悬浮固体上的油分，一般较难降到排放标准以下。
根据使用情况，隔油池内如果面层油脂超过5cm厚度，就必须排油，隔油池底部设置有两个排污口，加装阀门后平时关闭，彻底清理隔油池时可打开阀门，将隔油池内水和底部积泥全部排出，安装时要将油水分离器（隔油池）调整到水平位置，通入含油废水，再次调节水位调节管，直到排油管只排油不排水即可，第1次使用前应把设备注满自来水，调节水位调节管，使水位调节管的顶部与溢油槽上边缘处于同一水平面进水管的位置应与杂物分离箱保持一定的距离，以方便将杂物分离箱取出为宜。
